浅間山の山麓に，地球化学，地質学，岩石学の立場から火山を研究する目的で，１９５５年に小諸火山化学研究施設が設立され，地下水の水位，水質，溶存成分の測定が行われてきた．最近は，浅間火山観測所と一体化して，浅間山の火山活動を総合的に研究する一翼を担っている． とくに，２００４年噴火以後，定常観測点の強化を行ってきている．２００６年度にかけては，浅間火山観測所，小諸火山化学研究施設，および，軽井沢測候所間のデータの光ケーブルを利用したVLANによるデータ流通システムを完成させた．